Okulumuz 19/07/2012 tarihli Olur ile 2012-2013 eğitim öğretim yılında Marmaris Beldibi Mahallesinde bir ortaokul ve iki lise sınıfı olmak üzere toplam üç sınıf ile eğitim öğretim hayatına başlamıştır.
2013-2014 eğitim ve öğretim yılında iki sınıflı ortaokulumuz sınıf yetersizliği nedeniyle Beldibi Sıtkı Zaralı İlköğretim okulunda kendilerine tahsis edilen iki derslikte eğitim ve öğretimlerine devam etmiş, iki sınıf üç şubeden oluşan lisemiz Beldibi Mahallesindeki binasında eğitim ve öğretimine devam etmiştir.
Marmaris ilçesinde aynı türde eğitim veren başka bir okul olmaması ve öğrenci sayısının hızla artması sonucu 2014-2015 eğitim ve öğretim yılında İhsan Mermerci Mesleki ve Teknik Anadolu Lisesinin 12 derslikli ek binasına taşınmıştır.
2020-2021 eğitim öğretim yılında Milli Eğitim Bakanlığı Din Öğretimi Genel Müdürlüğü tarafından 30 kontenjan verilerek Fen ve Sosyal Bilimler Programı Uygulayan Proje Okulu'na dönüştürülmüştür.